甲硝唑注射液主要用于，厌氧菌感染的治疗。用法为静脉滴注，厌氧菌感染用量，成人儿童常用量一致，静脉给药首次按照体重15毫克每千克，维持量按体重7.5毫克每千克，每6到8小时静脉滴注一次。
孕妇及哺乳期妇女禁用，由于老年人肝功能减退，应用本品时药动学有所改变，应严密监测本品血药浓度，不良反应包括消化道反应，如恶心、呕吐等。神经系统症状有头痛、眩晕等。少数病例发生麻疹、潮红、瘙痒、膀胱炎、排尿困难、口中金属味及白细胞减少等，均属可逆性。
停药后自行恢复，有活动性中枢神经系统疾患，和血液病者禁用，注意事项包括，一对诊断的干扰，本品代谢产物可使尿液呈深红色。
二原有肝脏疾患者，剂量应减少，出现运动失调，或其他中枢神经系统症状时应停药，重复一个疗程前，应做白细胞计数，厌氧菌感染合并肾功能衰竭者，给药间隔时间，应由8小时延长至12小时。
三本品可抑制酒精代谢，用药期间应戒酒，饮酒后可能出现腹痛、呕吐、头痛等症状，本品能增强华法林等抗凝药物的作用。
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