新型冠状病毒肺炎检测主要靠咽拭子，痰液或其他下呼吸道分泌物、血液或粪便标本中检测出新型冠状病毒核酸阳性。需要规范的采集标本，避免外界的污染。下呼吸道痰液检测阳性率要高于咽拭子，除了核酸检测试验以外，如果病毒基因测序与新型冠状病毒高度同源，也可以作为确诊依据。
新冠肺炎实验室检查还包括肺CT、血常规、C-反应蛋白等。尤其是肺CT检查具有重要的诊断意义。新冠肺炎患者的肺CT可以表现出多发斑片状炎症阴影，具有间质性改变。如果是进展期可，出现双肺多发磨玻璃样阴影。如果患者有流行病学史，肺CT符合冠状肺炎标准，也可以成为临床诊断病例，这种患者需要隔离观察治疗，等待核酸试验阳性为确诊病例。
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