纵隔生殖源性肿瘤一般采用手术进行治疗。在前纵隔胸腺瘤、神经源性肿瘤、后纵隔神经源性肿瘤的治疗上，通常采用开放性手术及微开刀治疗。
有恶性成分、恶性生物学行为的胸腺瘤或畸胎瘤，患者手术后应加用放射、化疗，防止复发。其他科室还需辅助化疗，比如前纵隔肿瘤、血液系统淋巴瘤等。
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