甲胎蛋白是一种糖蛋白，正常情况下，这种蛋白主要来自胚胎的肝细胞，胎儿出生后约两周甲胎蛋白从血液中消失，因此正常人血清中甲胎蛋白的含量尚不到20微克/升。
甲胎蛋白由新生的幼稚肝细胞分泌，胎儿的肝细胞没有发育（分化）完全，分泌的甲胎蛋白量很大，所以孕妇的甲胎蛋白会阳性。肝癌是尚未分化的肝细胞，当然能大量分泌甲胎蛋白。孕妇在分娩1年后体内的甲胎蛋白就会恢复正常，正常值为每升血内甲胎蛋白含量不超过20微克，如果甲胎蛋白升高到每升血400微克以上，那么患肝癌的机率就很大了，这时还要进行超声波检查，因为有30％~40％肝癌患者的甲胎蛋白不会升高，所以需要进行综合检查。
双胎孕期甲胎蛋白值比单胎高一些，所测350ng/ml在正常范围，高于正常值三倍以上才有临床意义。
单胎妊娠有参考值：孕21周均值82.3，3 倍值246.9，双胎应大于493以上才有意义。目前用测甲胎蛋白值来筛查神经管畸形，孕21周以后一般不做这项检查。可用B超监测神经管畸形的。
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