1、三峡水电站每年发电847亿千瓦时，与火电相比，少燃烧5000万吨原煤，可以有效地减少对周围环境的污染，具有巨大的环境效益。每年可少排放1000万吨二氧化碳，100万吨二氧化硫，1万吨一氧化碳，37万吨氨氧化合物，以及大量的废水、废渣；可减轻因有害气体的排放而引起的酸雨的危害。 2、三峡工程还可使长江中下游枯水季节的流量显著增大，有利于珍稀动物白暨豚及其它渔类安全越冬，减免因水浅而发生的意外死亡事故；还有利于减少长江口盐水上溯长度和人侵时间，减少上海市区人民吃“咸水”的时间。 3、三峡水库蓄水后，枯水季节长江中下游流量增加，水深增大，对白鳍豚越冬极为有利，搁浅死亡可望避免 4、三峡工程在每年10月份开始蓄水，将使下泄流量比天然流量有所减少，这就有可能干扰中华鲟在葛洲坝工程下游的栖息和产卵活动。 5、建库后，冬季气温增高、湿度减小，对冬雾的形成不利，所以冬雾将有所减少。但在秋季尤其是深秋时节，雾日将略有增加，年平均少于2天，对长江航运不会造成较大影响。 同时不利影响还主要表现在以下4个方面： 第一，会加剧库区原已比较尖锐的人多地少的矛盾。三峡水库正常蓄水位175米时，淹没耕地和园地36万亩；移民安置区内的城市、县城、集镇、农村居民点、工矿企业迁建，公路等专业项目复建，还要占用近7万亩耕园地。这就加剧了三峡库区原已比较尖锐的人多地少的矛盾，如果没有恰当而有力的措施，只坚持就近后靠，只在扩大耕园地上下功夫，势必造成大面积毁林开荒、陡坡种植，造成新的水土流失，进一步使生存环境恶化，农村移民不但无法致富，还给库区经济的进一步发展造成困难。尤其是在国家规定25度以上坡地必须退耕还林、还草，既度以下坡地必须改造成梯地之后，三峡库区农村移民安置的环境容量进一步缩小。如何做到既要使农村移民“搬得出，稳得住，逐步能致富”，又要保护好库区的生态环境，促使库区的生态环境向良性循环转化，成为消除三峡工程对生态环境不利影响的第一项重要任务。 第二，会使三峡库区局部江段的水质污染进一步加重。三峡工程建成之前，库区局部江段的水质污染就已十分严重，但由于长江水流的流量大、流速快，使其自净能力强，后果还不严重。三峡水库蓄水后，尤其是在冬季，上游来水量减少，使水库内的水体流速减缓，复氧和扩散能力下降，如不及时对各种污染源进行治理，大量工业废水和生活污水仍然排人长江，局部江段水质污染必将进一步加重，甚至威胁城镇生活用水的水源地。因此，遵照国家有关生态环境保护的法律法规，对三峡库区的工业废水及固体废弃物必须限期治理；对生活污水和垃圾也必须限期治理，成为消除三峡工程对生态环境不利影响的第二项重要任务。 第三，三峡水库蓄水后，将会使一些不稳定的崩塌体、滑坡体滑入长江，有的将会威胁当地人民生命财产安全，如何在三峡水库蓄水前，就将一些已经预测到的不稳定的崩塌体、滑坡体加以治理（有的可采取工程治理，有的可采取搬迁避让），成为消除三峡工程对生态环境不利影响的第三项重要任务。 第四，三峡水库蓄水后，将使西陵峡上半段以及一些支流上低山形成的峡谷的近景景观受到一定影响；还将使淹没区内的地面文物和地下文物被淹没。因此，做好三峡库区景观保护和开发规划，并认真加以实施；遵照国家有关文物保护的法律法规，对地面和地下文物进行抢救性保护和发掘，成为消除三峡工程对生态环境不利影响的第四项重要任务。
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