和萨基卡佩罗出于战术层面引发的争执不同，罗伯特.巴乔与里皮之间完全就是个人的恩怨，特别是在国际米兰的那一个赛季。
在意大利足球史上无可否认里皮的伟大，但也不能不承认他同时也是一个固执的教练，包括巴乔在内，他和因扎吉、安布罗西尼还有帕努奇等球员之间同样产生过隔阂，只不过由于巴乔的伟大，才让他们之间的矛盾被无限放大。
从1990年的夏天加盟尤文到1994年射失那记功败垂成的点球，托着一条伤腿的巴乔用欧洲金球和世界杯亚军证明了自己的实力。不过他率领的尤文图斯在意甲赛场依然无法取得突破，被三连冠的AC米兰死死压在了身下。于是率领重建的那不勒斯获得联盟杯资格的里皮替代无心恋战的特拉帕多尼成为斑马军团的新主帅。
1994—95赛季拉开战幕后，巴乔经历赛季初几场比赛的闪光后就不幸遭遇到伤病的再次袭击，被迫休整了三个月。在此期间，里皮开始重用当时年仅20岁的德尔.皮耶罗，虽然皮耶罗整个赛季29场联赛只射进了8粒进球，但他和维亚利、拉瓦内利间形成了良好的化学反应，尤其是凭借积极的跑动获得了里皮的喜爱。
伤愈复出后的巴乔也在三条战线上屡屡打进关键进球，在全队的共同努力下，尤文图斯时隔九年再次捧起了联赛冠军奖杯，这无疑确立了里皮在这支球队中的绝对地位。
赛季结束后，尤文高层立即通知巴乔必须消减三分之一的年薪才能续约，而且无法保证他的主力位置。对于才28岁、正值当打之年的巴乔来说无疑是逼迫他走人之举，这也是他和里皮之间产生矛盾的序曲。
1997—98赛季，国际米兰在和尤文图斯的竞争中痛失联赛冠军，有着强烈复仇愿望的莫拉蒂从博洛尼亚引进了焕发第二春的老将罗伯特.巴乔。一年后取代霍奇森的里皮带来了维耶里和尤戈维奇等多位旧部，还先后从皇马挖来西多夫和帕努奇，这样包括罗纳尔多、雷科巴和萨莫拉诺在内，蓝黑军团的前场集中了多名世界级的球星。
早在接手国际米兰之前，里皮应该对这支球队更衣室环境的险恶早有所闻，为了笼络人心，同时主动化解与巴乔之间的矛盾，赛季开始前两人之间曾经有过一番交流。据巴乔自传《天上的门》中所述，当时里皮承诺给他一个主力位置，前提是要求他充当更衣室眼线的角色，要及时向里皮汇报球员的最新举动，但是被他不留情面的当面拒绝。
此举毫无疑问让两人之间的关系迅速恶化，接下来的1999—2000赛季，巴乔在里皮麾下只得到了19场的出场机会，而且大多是以替补的身份。饶是如此，罗伯特.巴乔也为国际米兰奉献了7粒进球，特别是和帕尔马争夺欧冠资格的附加赛，他一人梅开二度，为内拉们奉献了他在这支球队最后的两粒进球。赛后被《米兰体育报》打出了10分的满分。
巴乔用自己的职业精神拯救了球队，同时保住了里皮的主帅职位，却让自己在两人的竞争中被迫离开。
时至今日，里皮和巴乔之间的矛盾依然没有化解的迹象。颜强在一次采访中曾经问过里皮：“你认为巴乔是一名冠军球员吗？”里皮当即表示他不想讨论这个话题。
巴乔的两本自传都是首发即买，书中说里皮想让巴乔当他的联络人，即队内有什么问题，或者谁有什么不满，第一时间告诉里皮……巴乔认为这是一种对更衣室和队友的背叛，拒绝了……结果就是巴乔被其他人替代了，无论代理人的位置还是球场上的位置……
巴乔和里皮，一个是意甲最近几十年最具人气的球星，另一个是意大利足球的功勋主帅，巴乔和里皮曾共事过两次，一次是在1994-1995赛季的尤文图斯，另一次是在1999-2000赛季的国际米兰。
外界向来觉得巴乔和里皮之间的关系很微妙，因为巴乔两度在里皮帐下效力，却都是一个赛季后就马上离队。
从战术打法上来说，里皮与巴乔的分歧不算大，两人之间的分歧，至少没有“铁血足球”打法的萨基或卡佩罗与“技术流”巴乔之间的分歧那么大。里皮并不排斥纯技术流球星，只不过巴乔运气不好，在里皮接手尤文图斯的时候，巴乔重伤了。尤文图斯启用新人皮耶罗，感觉效果也不错。
实际上，1994-1995赛季的巴乔，状态还是比皮耶罗好，皮耶罗29场比赛打进8球，而巴乔只用了17场比赛就打进8球。不过当时的队长巴乔合同期快满了，皮耶罗又有年龄优势，于是，尤文图斯就动了卖掉巴乔的想法，巴乔的这次转会，并不能完全说是因为里皮。
真正让两人关系恶化的，应该在是1999-2000赛季在国际米兰的那次合作，那年巴乔和里皮又相遇了，在里皮帐下，巴乔变成可有可无的球星了。不过随着罗纳尔多和维埃里先后受伤，萨莫拉诺和雷科巴状态又没那么稳，巴乔重新披挂上阵，在意甲附加赛以一己之力把国际米兰队拿到欧冠参赛资格。但此时里皮表示，有他无我，巴乔又是选择离队。
顽固的里皮甚至直接对巴乔说“你最好离开国际米兰。”而巴乔在自传《天上的门》中把里皮视为敌人，两人甚至因此对薄公堂。在成功带领意大利获得德国世界杯冠军后，里皮在一次专访中表示永远不会和巴乔和解，而巴乔也表示，如果不是某人，他会在国际米兰结束自己的职业生涯。巴乔说的某人，很明显就是里皮！
上文说到了，巴乔和里皮的矛盾，并非技战术层面的分歧，更多是性格方面的冲突。里皮觉得巴乔应该帮他掌控更衣室，而巴乔觉得给里皮当更衣室“眼线”是不厚道的行为。里皮注重个人权威，巴乔性情清高，这些不配合的行为，让里皮觉得很不满，偏偏巴乔容易受伤，又让里皮觉得巴乔可有可无。两次“不合作”的结果，都是以巴乔离队而告终。对此，你怎么看？
问题的关键，首先还是巴乔不符合里皮的足球理念。所以巴乔就是可牺牲的那一个。
帕柳卡曾经给出一个技术性的解释，那就是442。当时意甲流行这样最为平衡的阵型体系，前锋虽然有两个，但防守也从前锋脚下发起。凭借坚固的防守和高效率快速的战术配合赢得比对方更多的进球机会。这要求严格的纪律和更快的跑位出球。但巴乔则属于需要相当自主权的攻击手。他在进攻方面几乎全能（但要有强力中锋做配合），但要队友按照他的节奏配合他，在教练眼中缺乏效率。而防守则完全指望不上他。以前曾有人说过他，进攻顶一个半，防守顶半个一。这是他不为里皮，萨基，卡佩罗，安切洛蒂，乌里维埃里所容的最基本的要素。也是巴乔生涯后期一切遭遇的前提。
第二，但即便在这些拒绝巴乔的教练心里，巴乔也并不是没有用。巴乔无数次证明了，在球队打不开局面和落后情况下，他上去后会有意想不到的效果。尤其是他有着无与伦比的大场面适应力，越是困难越敢发挥。巴乔只有一条半腿，27岁之前各种风驰电掣，27岁之后只用球商踢球。他会用超人的洞察力看破对方防线的弱点，一步十计，算路精准。然后用最简单的方式进球或者让别人进球。所以说，里皮其实愿意用巴乔做替补，而且经常有不错的效果。
最后，问题的症结来了。巴乔是意大利之子，在意大利人心中是“我们的马拉多纳”。而巴乔自己虽然谦逊过人但在足球上极其骄傲。他是不能容忍自己被低估和误读的。一旦巴乔上场进球，球迷媒体就会呼啸鼓噪，为什么他不能首发。而很多队友也会诧异，为什么他进个球特么那么简单，我们累死累活跟傻子一样，还不如把球交给他。所以巴乔会把球队的战术纪律带偏……
而卡佩罗，里皮都是那种强调个人权威的教练。他们不能容忍球员的威望凌驾于自己头上。而媒体的鼓噪在他们看来，就是巴乔的反抗。
最后当了坏人还解释不清楚的里皮完全忍不了了。训练中巴乔进个漂亮球，队友他鼓掌掌居然也能被里皮骂一顿，毫无风度可言。既然相看两厌，那就摊牌好了。
巴乔可以离开，但不是因为我不行，所以我一定要进两个球，还是进的布冯守的门。
而里皮呢，我从来不否认你能进球，那又怎么样？球队只许有一个声音，是我……
后期的巴乔，展现能力的空间无疑在缩小，条件变得苛刻，很难在漫长的联赛中保持全状态出战。但在对成绩没有过高要求、又能尊重他的小球队还能如鱼得水。因为信仰，他的生活简单而自律，没有多余的消耗。所以他的状态虽然恢复的慢，却总能回得来。长期用脑踢球也让他能够精密运控身体，一个又一个地不断进球。每一个都那样简单、轻巧、致命，一直到退役……
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